產(chǎn)品分類PRODUCT CLASSIFICATION
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賽默飛世爾科技的QuantStudio™ 3實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)是一款經(jīng)典的96孔基礎(chǔ)型qPCR儀,其耗材和試劑選擇非常成熟和廣泛。總的來說,您需要準(zhǔn)備以下幾大類:
一、賽默飛QuantStudio3實(shí)時(shí)熒光定量PCR核心耗材
1、反應(yīng)板/板膜組合
QuantStudio 3是96孔標(biāo)準(zhǔn)模塊,因此您需要選擇96孔的板子和對應(yīng)的密封膜。賽默飛提供了多種選擇以適應(yīng)不同的實(shí)驗(yàn)需求和預(yù)算:
(1)微孔板:
標(biāo)準(zhǔn)96孔板: 常用的類型,例如 MicroAmp™ Fast Optical 96-Well Reaction Plate (貨號: 4346906)。
光學(xué)級96孔板: 確保良好的光學(xué)性能,減少信號交叉干擾。
(2)密封膜:
光學(xué)平蓋膜: 與大多數(shù)試劑兼容,需要專用的壓膜工具密封,密封性好。例如 MicroAmp™ Optical Adhesive Film (貨號: 4311971)。
八聯(lián)管蓋: 如果您使用八聯(lián)管,則需要匹配的管蓋。例如 MicroAmp™ Optical 8-Cap Strip (貨號: 4323032)。八聯(lián)管的好處是可以在部分孔中進(jìn)行實(shí)驗(yàn),靈活性高。
二、賽默飛QuantStudio3實(shí)時(shí)熒光定量PCR核心試劑
qPCR試劑是反應(yīng)發(fā)生的化學(xué)基礎(chǔ),主要分為兩大類:染料法和探針法。
1、預(yù)混液
這是常用、方便的形式,已將DNA聚合酶、dNTPs、緩沖液等組分預(yù)先混合好,用戶只需加入引物、模板和水即可。
(1)SYBR Green法(染料法):
PowerUp™ SYBR™ Green Master Mix (貨號: A25742): 性能優(yōu)異,含有ROX染料校正,適合大多數(shù)應(yīng)用。
SYBR™ Green PCR Master Mix: 經(jīng)典選擇。
特點(diǎn): 經(jīng)濟(jì)、通用性強(qiáng),但特異性略低于探針法,需要配合熔解曲線分析來確認(rèn)產(chǎn)物的單一性。
(2)TaqMan法(探針法):
TaqMan™ Fast Advanced Master Mix (貨號: 4444557): 快速、靈敏,是進(jìn)行探針法qPCR的重要選擇。
特點(diǎn): 特異性高,適用于多重檢測(同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)基因),但成本較高,需要針對特定基因序列設(shè)計(jì)并合成探針。
2、關(guān)鍵組分
如果您不使用預(yù)混液,則需要自行配制體系,包括:
熱啟動Taq DNA聚合酶
dNTPs
緩沖液
鎂離子
熒光染料 或 探針
對于絕大多數(shù)用戶,直接購買預(yù)混液是高效、可靠的選擇。
三、其他輔助耗材與試劑
1、樣品制備階段:
(1)RNA/DNA提取試劑盒: 如 Invitrogen™ PureLink™ 系列。
(2)無核酸酶水: 用于稀釋和配制反應(yīng)體系。
(3)RNase抑制劑: 如果進(jìn)行RT-qPCR,用于防止RNA降解。
2、液體操作:
(1)無濾芯吸頭: 用于移取模板、引物等。
(2)帶濾芯吸頭: 強(qiáng)烈推薦用于移取預(yù)混液,可防止氣溶膠污染和交叉污染。
(3)PCR管/板: 用于配制主混合物。
3、逆轉(zhuǎn)錄試劑(用于RT-qPCR):
如果您是從RNA開始實(shí)驗(yàn),需要先將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA。例如 SuperScript™ IV First-Strand Synthesis System。
四、總結(jié)與工作流程示例
一個(gè)典型的SYBR Green RT-qPCR實(shí)驗(yàn)流程所需清單如下:
1、RNA提取: RNA提取試劑盒、無RNase的離心管和吸頭。
2、逆轉(zhuǎn)錄: 逆轉(zhuǎn)錄酶、隨機(jī)引物/ Oligo dT、dNTPs、RNase抑制劑、無核酸酶水。
3、qPCR反應(yīng)體系配制:
(1)試劑: PowerUp? SYBR? Green Master Mix、基因特異性引物、無核酸酶水、cDNA模板。
(2)耗材: 96孔反應(yīng)板、光學(xué)粘封膜、帶濾芯的吸頭、用于配制主混合物的離心管。
4、上機(jī)運(yùn)行: 將密封好的反應(yīng)板放入QuantStudio 3中,設(shè)置程序并運(yùn)行。