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賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)的 ProFlex? 3x32 PCR 系統 是一款高度靈活、可配置的梯度PCR儀(支持三個獨立溫區,每個溫區可放置不同的模塊,如標準96孔、快速96孔、雙槽384孔等)。根據您的實驗需求,運行該系統通常需要以下耗材和試劑:
一、賽默飛ProFlex 3x32PCR系統核心耗材
1、PCR板或管:
(1)與模塊匹配的耗材至關重要。系統支持多種模塊,請根據您使用的模塊類型選擇:
96孔模塊:使用標準的 0.2ml 8聯排管(PCR條管) 或 96孔PCR板。
384孔模塊:使用專用的 384孔PCR板。
(2)材質:推薦使用高質量、薄壁、光學透明的聚丙烯材質,以確保熱傳導和熒光檢測兼容性(如果后續需要進行qPCR,但ProFlex本身是普通PCR儀)。
2、封蓋材料:
(1)對于PCR板:
光學透明封板膜:密封性好,兼容后續的熒光檢測(如在其他儀器上做qPCR分析)。
熱封膜:使用熱封儀密封,是防止蒸發和交叉污染可靠的方式之一。
壓敏型封板膜(可撕式):使用方便,但需確保按壓緊密。
(2)對于8聯排管:
平蓋或凸蓋:根據PCR儀熱蓋類型選擇。ProFlex使用自動壓力熱蓋,能適應不同高度的管蓋,但需確保所有管蓋高度基本一致。
管蓋通常隨管一起購買。
二、賽默飛ProFlex 3x32梯度PCR系統核心試劑
1、PCR主反應混合物:
(1)預混液:推薦使用 Taq DNA聚合酶預混反應液(2× PCR Master Mix),其中已包含Taq酶、dNTPs、MgCl?、反應緩沖液等。使用方便,重復性好。例如,賽默飛的 TaqMan® Fast Advanced Master Mix(用于探針法qPCR的預混液,也可用于普通PCR)或 Platinum™ Taq DNA Polymerase 系列。
(2)或自行配制:需要單獨購買:
耐熱DNA聚合酶(如Taq酶)
10× PCR反應緩沖液
氯化鎂
dNTP混合物
2、模板DNA:您要擴增的目標DNA,濃度和純度需合適。
3、引物:針對目標序列特異設計的上游和下游引物,通常以干粉或儲存液形式提供,使用時稀釋到工作濃度。
4、無核酸酶水:用于補足反應體積,并稀釋模板和引物。務必使用無核酸酶的水或TE緩沖液,以避免DNA降解。
三、可選/輔助試劑與耗材
1、陽性對照:含有已知目標序列的DNA模板,用于驗證PCR體系是否正常工作。
2、陰性對照:
(1)無模板對照:用無核酸酶水代替模板DNA,用于檢測試劑或環境是否存在DNA污染。
(2)無引物對照:用等體積水代替引物,用于檢測模板是否有殘留雜質。
3、染料(用于普通PCR終點檢測):
(1)上樣染料:如果PCR產物后續需要進行瓊脂糖凝膠電泳,可在反應完成后加入或在配制預混液時加入。
(2)在凝膠電泳中顯影的染料:如溴化乙錠、SYBR® Safe等更安全的替代品。
4、用于梯度PCR優化的試劑:當您使用梯度功能尋找退火溫度時,可能需要準備多管/多孔的相同反應體系,以便在不同溫度下同時測試。
四、重要操作提示:
1、模塊與耗材匹配:在開機前,務必確認儀器中安裝的模塊類型(可從儀器觸摸屏的“模塊設置"中查看),并選擇與匹配的耗材。錯誤的耗材會導致熱蓋壓力不均、熱傳導不佳甚至損壞儀器。
2、建立和保存程序:充分利用ProFlex的三區獨立梯度功能。您可以為每個區設置獨立的溫度程序,包括在退火步驟設置溫度梯度(例如,A區設置為58°C,B區為60°C,C區為62°C;或每個區內也可設置梯度)。程序可以在觸摸屏上輕松創建和保存。
3、防止污染:操作時務必佩戴手套,并在專門的超凈工作臺或干凈區域配制反應體系,與加模板DNA的區域分開。
4、體系體積:確保反應體系體積在推薦范圍內(通常20-50μl),并遵循PCR板/管的體積要求。
總結清單:您每次實驗前需要準備的是:
匹配模塊的PCR板/管 + 密封膜/蓋 + PCR預混液 + 模板DNA + 引物 + 無核酸酶水 + 對照品 + 移液用品。